Degradación de Edman

  La degradación de Edman, desarrollada por Pehr Edman, es un método de secuenciación de aminoácidos en un péptido.^[1] En este método, el residuo amino-terminal se etiqueta y se separa del péptido sin afectar a los enlaces peptídicos entre los otros residuos.

Mecanismo

Conocimientos adicionales recomendados

Procedimientos normalizados de trabajo (PNT) para la comprobación de balanzas

Guía de técnicas básicas de medición en el laboratorio

Cómo realizar un pesaje correcto

En medio básico, se provoca la reacción del extremo amino con fenilisotiocianato para formar un péptido feniltiocarbamilado. A continuación, se aplica un medio ácido para que el tiocarbamoilo forme un ciclo de 5 miembros (feniltiohidantoina) con el carbonilo del enlace peptídico adyacente. De este modo, se obtiene un péptido más corto, con un nuevo extremo amino y la feniltiohidantoina del primer aminoácido.

Limitaciones

No es posible secuenciar péptidos cuyo extremo N-terminal se encuentre bloqueado (grupo amino acetilado, formilado, etc). Alrededor del 50% de las proteínas tienen el extremo amino bloqueado, bien por naturaleza o por su preparación, en tampones con sustancias susceptibles de reaccionar con este: (cianato, ácido acrílico, aldehído...).

Referencias