Conocimientos adicionales recomendados
donde es la profundidad del potencial, es la distancia (finita) en la que el potencial entre partículas es cero y r es la distancia entre partículas. Estos parámetros pueden ser ajustados para rerpoducir datos experimentales o pueden ser deducidos de resultados muy precisos de cálculos de quimica cuantica. El término describe la repulsión y el termino describe la atracción. La función que describe la fuerza a la que estan sujetas las partículas es el negativo del gradiente del potencial arriba descrito
Formas alternativasLa función del potencial de Lennard-Jones comúnmente se escribe de la siguiente forma: donde = es la distancia en la que el potencial se encuentra en un mínimo. La formulación más sencilla, usada comúnmente por software de simulación, es:
donde
y . Simulación de Dinámica Molecular: Potencial truncadoEn general, para ahorrar tiempo computacional, el potencial de Lennard-Jones es truncado en la distancia límite de donde
i.e., en , el potencial LJ es aproximadamente 1/60 de su valor mínimo (profundidad del potencial). Después de , se le asigna el valor 0 al potencial computacional. Por otro lado, para evitar una discontinuidad en , como se muestra en la ecuación 1, el potencial de LJ es desplazado ligeramente hacia arriba, de tal forma que el potencial computacional sea 0 exactamente en la distancia límite . Referencias
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