¿Cómo se juega al Tetris de Catálisis?
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¿Te gusta jugar al Tetris? Especialmente en los niveles superiores, cuando hay que empujar las piezas de forma intrincada en el mejor lugar muy rápidamente... En cierto modo, los científicos que se dedican a la investigación de la catálisis computacional suelen tener que dominar una tarea similar. Una de las variables principales que calculan regularmente con un sofisticado software de simulación mecánica cuántica es la fuerza con la que una molécula se une a la superficie de un posible material catalizador. La relevancia de esta información ya fue descubierta hace unos cien años por el Premio Nobel Paul Sabatier: Si el enlace es demasiado débil, la molécula no se activa lo suficiente como para ser convertida eficazmente en la reacción catalítica. Si el enlace es demasiado fuerte, ya no participa en la reacción, sino que simplemente bloquea la superficie del catalizador.
Los cálculos de mecánica cuántica pueden proporcionar esta importante información con gran precisión, y cada vez se utiliza más para una evaluación inicial de la idoneidad de un nuevo material catalizador antes de que el material se sintetice incluso en un entorno de laboratorio del mundo real que requiere mucho trabajo. Por desgracia, los cálculos requieren superordenadores y, al igual que en el Tetris, hay diferentes posiciones en la superficie donde la molécula podría adherirse. Probando todas las posiciones, cada una con su propio cálculo, los científicos determinan dónde encaja mejor la molécula. Las moléculas más grandes y complicadas también pueden unirse a las posiciones de diferentes maneras y orientaciones, de nuevo, como una pieza de forma complicada en el Tetris. Teniendo en cuenta que decenas de moléculas intervienen en importantes reacciones catalíticas como la de Fischer-Tropsch para producir combustibles sintéticos, simplemente se tarda demasiado en realizar el enorme número total de cálculos necesarios. Se acabó el juego.
Los jugadores experimentados de Tetris desarrollan una sensación de dónde empujar mejor las piezas. "Los algoritmos de aprendizaje automático funcionan igual", explica Wenbin Xu, estudiante de doctorado del Instituto Fritz Haber. Tras ser entrenados con los resultados de cálculos anteriores para moléculas y superficies de catalizadores similares, estos algoritmos pueden hacer predicciones fiables sobre la unión sin necesidad de más tiempo de supercomputadora y mucho, mucho más rápido. No es de extrañar que el desarrollo de algoritmos adecuados sea un tema candente. Sin embargo, hasta ahora los algoritmos no han sido capaces de lidiar adecuadamente con moléculas más complicadas. Sólo pudieron predecir la unión de pequeñas moléculas que podían unirse a la superficie en una sola orientación obvia, como una simple pieza cuadrada de Tetris. "La información que faltaba para los algoritmos era el enlace dentro de la molécula: qué átomo se une a qué...", describe la profesora Mie Andersen, de la Universidad de Aarhus. Utilizando la teoría matemática de los grafos, el equipo de investigación ha encontrado ahora una forma de incorporar esta información de forma adecuada. Su nuevo algoritmo de aprendizaje automático, publicado en Nature Computational Science, ya proporciona información precisa sobre la unión de moléculas de mayor tamaño que intervienen en el proceso Fischer-Tropsch y otras reacciones de generación de combustible. Los investigadores de la catálisis tienen ahora un poderoso jugador de Tetris a su lado.
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Publicación original
"Predicting binding motifs of complex adsorbates using machine learning with a physics-inspired graph representation."; Nature Computational Science 2, 443 (2022)